Подвижность молекул воды, мочевины и триметиламиноксида вблизи глобулярного белка
- Статья поступила: 13.12.2018 г.
- С доработки: 11.01.2019 г.
- Принята к публикации: 18.01.2019 г.
- DOI 10.26902/JSC_id40566
- Просмотров: 385
1 Институт химической кинетики и горения им. В.В. Воеводского СО РАН, Новосибирск, Россия
2 Новосибирский государственный университет, Россия
C использованием полноатомного
молекулярно-динамического моделирования исследовали подвижность молекул в
гидратной оболочке глобулярного белка SNase в водном растворе с косольвентами
(мочевина и триметиламиноксид). Для молекул, изначально расположенных в
последовательных слоях вокруг белка, рассчитывали средние смещения за один и
тот же короткий промежуток времени. Это позволило характеризовать диффузионную
подвижность молекул в зависимости от расстояния до белка. Показано, что
молекулы растворителя имеют пониженную подвижность вблизи белка, а при удалении
от него подвижность молекул увеличивается неравномерно, коррелируя с положением
максимумов функции распределения соответствующих молекул вокруг белка. За
пределами второго максимума этих функций подвижность достигает своих объемных
значений как для воды, так и для косольвентов.
Ключевые слова: молекулярно-динамическое моделирование, водные растворы, триметиламиноксид, мочевина, гидратная оболочка, косольвенты
|
Импакт-фактор 2023 1.2 |
||||
|
Срок опубликования 4 мес |
||||
Уважаемые авторы и подписчики “Журнала структурной химии”,
в свободном доступе
архив ЖСХ до 2020 года ("Номера").
Спецвыпуски
Самое интересное
Статьи, к которым чаще всего обращаются посетители
Рубрики