Журнал

Том 58

Февраль - Март

№2, 2017

Строение биологически активных соединений

Содержание

К списку номеров

Теория строения молекул и химической связи

стр.233

Л.С. Нечаева, Е.В. Бутырская, С.А. Запрягаев

Компьютерное моделирование сорбции аминокислот на углеродных нанотрубках

Ключевые слова: углеродная нанотрубка, глицин, аланин, фенилаланин, компьютерное моделирование, энергия адсорбции

стр.242

Г.Н. Тен, О.Е. Глухова, М.М. Слепченков, Н.Е. Щербакова, В.И. Баранов

Теоретическое исследование механизма таутомерного превращения в димере 7-азаиндола и комплексе 7-азаиндола с молекулой воды методами оптической спектроскопии

Ключевые слова: 7-азаиндол, комплекс с водой, димер, таутомер, электронные спектры, низкочастотные колебания, спектры флуоресценции, вода

стр.253

М.С. Федоров, Н.И. Гиричева

Проявление гош-эффекта в конформерах гидразида бензолсульфоновой кислоты

Ключевые слова: ароматические сульфонилгидразиды, гидразид бензолсульфоновой кислоты, конформеры, NBO анализ, квантово-химические расчеты, гош-эффект, аномерный эффект, анализ

стр.261

A. Khaleghi-Rad, S.A. Beyramabadi, A. Morsali, M. Ebrahimi, M. Khorasandi-Chenarboo

Tautomerism of the antiepileptic drug Felbamate: A DFT study

Ключевые слова: Felbamate, Taloxa, DFT, PCM, tautomerism, intramolecular proton transfer

Исследование строения молекул физическими методами

стр.269

H. Tezcan, N. Tokay

Structural and spectral properties of 3-substitutedphenyl-1,5-diphenylformazans: A quantum chemical study

Ключевые слова: formazans, substituent effects, UV-vis spectra, TD-DFT, PCM

стр.278

A.G. Pacheco, G. Salgado-Moran, L. Gerli-Candia, R. Ramirez-Tagle, D. Glossman-Mitnik, A. Misra, A.F. De Carvalho Alcântara

Theoretical investigation of the molecular structure and spectroscopic properties of oxicams

Ключевые слова: nonsteroidal anti-inflammatory drugs, chemical properties, spectroscopic analysis, density functional theory

Структура жидкостей и растворов

стр.285

А.В. Аникеенко, М.В. Зеликман, Е.Д. Кадцын, Н.Н. Медведев

Моделирование ассоциатов глицирризиновой кислоты с холестерином в метаноле

Ключевые слова: молекулярно-динамическое моделирование, водные растворы, глицирризиновая кислота, холестерин, метанол, структура ассоциатов

стр.293

Г.А. Гамов, В.В. Александрийский, В.А. Шарнин

Строение сольватов пиридоксина в водном растворе по данным квантовохимических расчетов и спектроскопии ЯМР

Ключевые слова: пиридоксин, DFT, ЯМР, сольватация, таутомерное равновесие

Кристаллохимия

стр.300

Е.В. Миронова, Д.Б. Криволапов, И.А. Литвинов, Л.В. Мустакимова, В.А. Мамедов

Структура новых производных пергидропиримидин-2-онов и межмолекулярные взаимодействия в их кристаллах

Ключевые слова: пергидропиримидин-2-оны, кристаллическая и молекулярная структура, рентгеноструктурный анализ

стр.308

Ш.М. Адизов, Б. Ташходжаев, Р.Ж. Кунафиев, М.М. Мирзаева, П.Х. Юлдашев

Кристаллическая структура псевдокопсинина и его солей

Ключевые слова: индолиновые алкалоиды, псевдокопсинин, галоидные соли, РСА

стр.314

M. Ahmad, Z. Perveen, A.J. Bortoluzzi, S. Hameed, M.R. Shah, M. Tariq, G. ud Din, M. Anwar

Structural diversities and preliminary antimicrobial studies of 1-((E)-(pentylimino)methyl)naphthalen-2-ol and its metal complexes

Ключевые слова: 2-hydroxynaphthaldehyde, n-amyl amine, zwitterions, octahedral, centrosymmetric square planar, antimicrobial

Супрамолекулярные соединения и наноразмерные системы

стр.321

G. Yakalı, S.E. Öztürk, M. Aygün

Strong hydrogen bonded supramolecular architecture in a crystal of the {3-[2-(1,3-benzodioxol-5-yl)-7-methoxy-1-benzofuran-5-yl] propyl} diethylamine cation with the hydrogen bonded chloride hydrate anion (halides) assembly: X-ray structure analysis, DFT calculations, Hirshfeld surface analysis

Ключевые слова: crystal structure, benzofuran, bifurcated hydrogen bond, chloride hydrate, supramolecular architecture, tetramers, halides, DFT, Hirshfeld surface analysis

Обзоры

стр.332

Н.Н. Курусь, Ф.Н. Дульцев

Измерение силы раcкручивания двойной спирали ДНК

Ключевые слова: межмолекулярные силы, кварцевый резонатор, олигонуклеотиды, комплементарность, атомно-силовая микроскопия

Краткие сообщения

стр.357

А.В. Митин

Взаимная поляризация аминокислот в малом тетра-гем цитохроме с 1M1P

Ключевые слова: неэмпирический расчет, приближение ЛКАО, метод Хартри—Фока, молекулярные орбитали, анализ заселенности

стр.361

M. Mahani, S. Sheikhghomi, H. Sheikhghomi, J. Fasihi

Quantitative structure activity relationship study on binding affinity of some aminothiazole derivatives with dopamine receptor in brain

Ключевые слова: QSAR, partial least squares, soft modeling, structural descriptors, aminothiazole derivatives, dopamine receptor

стр.366

G.-J. Zha

Spin-forbidden CO binding to iron–sulfur cluster-free hydrogenase:
A density functional study

Ключевые слова: density functional theory, PHmd—CO, cluster-free hydrogenase

стр.370

Н.Ю. Шматко, Д.В. Корчагин, Г.В. Шилов, Н.А. Санина, С.М. Алдошин

Молекулярная и кристаллическая структура катионного динитрозильного комплекса железа с 1,3-диметилтиомочевиной

Ключевые слова: оксид азота (NO), динитрозильные комплексы железа, 1, 3-диметилтиомочевина, РСА

стр.373

Ю.И. Слывка

Кристаллическая структура π-комплекса AgClO₄ с 2-амино-
5-аллилтио-1,3,4-тиадиазолом состава [Ag(C₅H₇N₃S₂)(ClO₄)]

Ключевые слова: синтез, серебро(I), π-комплекс, 1, 3, 4-тиадиазол, кристаллическая структура

стр.375

Л.Д. Попов, С.А. Бородкин, В.В. Ткачев, Ю.П. Туполова, А.С. Бурлов, Г.В. Шилов, А.Н. Утенышев

Кристаллическая структура 2-метил-3-{[3-метил-5-оксо-1-фенилпиразол-4-илиден-метил]амино}-хиназолин-4-оната меди(II)

Ключевые слова: рентгеноструктурный анализ, комплекс меди(II), кристаллическая структура

стр.379

Е.В. Миронова, Д.Б. Криволапов, И.А. Литвинов, Л.В. Мустакимова, В.А. Мамедов

Молекулярная и кристаллическая структура
4-дихлорметилен-5-бензоил-6-фенил-пергидропиримидин-2-она
и его N(1)-замещенного аналога

Ключевые слова: 2(1H)-пиримидиноны, дегидратация пиримидинонов, рентгеноструктурный анализ, молекулярная и кристаллическая структура

стр.383

Л.Д. Попов, С.А. Бородкин, Ю.П. Туполова, С.И. Левченков, В.В. Ткачев, А.С. Бурлов, А.А. Цатурян

Молекулярная и кристаллическая структура нового основания Шиффа: 4-метил-N-[2-[(2-метил-4-оксо-хиназолин-3-ил)иминометил]фенил]бензолсульфонамида

Ключевые слова: основание Шиффа, рентгеноструктурный анализ, ЯМР, кристаллическая структура, молекулярное строение

стр.387

L. Jothi, G. Anuradha, G. Vasuki, R. Ramesh Babu, K. Ramamurthi

Crystal structure of N-(p-methylbenzylidene)-p-bromoaniline

Ключевые слова: synthesis, crystal structure, benzylidene, aniline, hydrogen bonding

Материалы XVII симпозиума по межмолекулярному взаимодействию и конформациям молекул, посвященного 100-летию со дня рождения А.И. Китайгородского. Россия, Владимир, 23–27 июня 2014 г.

стр.390

О.В. Гринева

Кристаллохимический анализ алифатических α,ω-диолов: возможности подходов А.И. Китайгородского и их развитие

Ключевые слова: метод атом-атомных потенциалов, межмолекулярные взаимодействия, энергия кристалла, энергетическое координационное число, полиморфы, конформации, симметрия молекул в кристаллах, водородные связи, Кембриджский банк структурных данных

стр.402

Т.В. Богдан, Е.С. Алексеев

Роль консервативной межспиральной водородной связи Ser74–Trp158 в сайте связывания холестерина в конформационной стабильности β₂-адренорецептора (молекулярно-динамическое моделирование)

Ключевые слова: β2-адренорецептор, межспиральная водородная связь Ser74—Trp158, мутация S74A, молекулярно-динамическое моделирование

стр.410

С.В. Пастон, А.И. Николаев, П.А. Ушков

Комплексы ЭДТА, тимидина и ионов Cu²⁺ по данным масс-спектрометрии

Ключевые слова: азотистые основания ДНК, ионы меди(II), ЭДТА, хелатные комплексы, масс-спектрометрия, электроспрей

стр.417

С.В. Пастон, А.М. Поляничко, О.В. Шуленина

Исследование взаимодействия ДНК с ионами Cu²⁺ и Mg²⁺ в присутствии кофеина

Ключевые слова: ДНК, кофеин, ионы металлов, УФ поглощение, круговой дихроизм, ИК спектроскопия, вторичная структура ДНК

стр.424

Н.А. Касьяненко, Z. Qiushi, М.С. Варшавский, В.М. Бакулев , В.Н. Демидов

Металлокомплексы ДНК и металлизация макромолекулы в растворе

Ключевые слова: ДНК, наночастицы и люминесцирующие нанокластеры серебра, Ag(Phen)2NO3, цис-ДДП

стр.431

И.Н. Унксов, Н.А. Касьяненко

Конформационные изменения молекулы ДНК в растворе, вызванные связыванием светочувствительного катионного ПАВ

Ключевые слова: фотоиндуцированная компактизация ДНК в комплексе с ПАВ, персистентная длина ДНК, транс—цис-изомеризация азобензольной группы

стр.438

Е.А. Морозова, Н.С. Линькова, В.Х. Хавинсон, А.Ю. Cоловьёв, Н.А. Касьяненко

Взаимодействие пептида AEDL с ДНК in vitro

Ключевые слова: тетрапептид AEDL, бронхиальный эпителий, ДНК-пептидные взаимодействия, круговой дихроизм, вискозиметрия

Подать статью

STRUCTURE OF BIOLOGICALLY ACTIVE COMPOUNDS
Theory of molecular structure and chemical bonding
Nechaeva L.S., Butyrskaya E.V., Zapryagaev S.A. Computer simulation of amino acid sorption on carbon nanotubes	233
Ten G.N., Glukhova O.E., Slepchenkov M.M., Shcherbakova N.E., Baranov V.I. Theoretical study of the mechanism of tautomeric transformations in the dimer of 7-azaindole and complex 7-azaindole with the water molecule by the methods of optical spectroscopy	242
Fedorov M.S., Giricheva N.I. Manifestation of Gauche Effect in benzenesulfonic acid hydrazide conformers	253
Khaleghi-Rad A., Beyramabadi S.A., Morsali A., Ebrahimi M., Khorasandi-chenarboo M. Tautomerism of the antiepileptic drug Felbamate: A DFT study	261
Study of the structure of molecules by physical methods
Tezcan H., Tokay N. Structural and spectral properties of 3-substitutedphenyl-1,5-diphenylformazans: a quantum chemical study	269
Pacheco A.G., Salgado-Morán G., Gerli-Candia L., Ramírez-Tagle R., Glossman-Mitnik D., Misra A., De Carvalho Alcântara A.F. theoretical investigation of the molecular structure and spectroscopic properties of oxicams	278
Structure of liquids and solutions
Anikeenko A.V., Zelikman M.V., Kadtsyn E.D., Medvedev M.N. Simulation of glycyrrhizic acid associates with cholesterol in methanol	285
Gamov G.A., Aleksandriiskii V.V., Sharnin V.A. Structure of pyridoxine solvates in an aqueous solution from quantum chemical calculations and NMR spectroscopy	293
Crystal chemistry
Mironova E.V., Krivolapov D.B., Litvinov I.A., Mustakimova L.V., Mamedov V.A. Structure of new derivatives of perhydropyrimidine-2-ones and intermolecular interactions in their crystals	300
Adizov Sh.M., Tashkhodzhaev B., Kunafiev R.Zh., Mirzaeva M.M., Yuldashev P.Kh. Crystal structure of pseudokopsinine and its salts	308
Ahmad M., Perveen Z., Bortoluzzi A.J., Hameed S., Raza Shah M., Tariq M., Ud Din G., Anwar M. Structural diversities and preliminary antimicrobial studies of 1-((E)-(pentylimino)methyl) naphthalen-2-ol and its metal complexes	314
Supramolecular compounds and nanosized systems
Yakalı G., Öztürk S.E., Aygün M. Strong hydrogen bonded supramolecular architecture in a crystal of the {3-[2-(1,3-benzodioxol-5-yl)-7-methoxy-1-benzofuran-5-yl] propyl} diethylamine cation with the hydrogen bonded chloride hydrate anion (halides) assembly: X-ray structure, dft calculations, hirshfeld surface analysis	321
Review
Kurus N.N., Dultsev F.N. Measurement of the unwinding force of a DNA double helix	332
Brief communications
Mitin A.V. Mutual polarization of amino acids in small tetra-heme cytochrome с 1M1P	357
Mahani M., Sheikhghomi S., Sheikhghomi H., Fasihi J. Quantitative structure activity relationship study on binding affinity of some aminothiazole derivatives with dopamine receptor in brain	361
Zha G.-J. Spin-Forbidden CO Binding to Iron—sulfur Cluster-free Hydrogenase: A Density Functional Study	366
Shmatko N.Yu., Korchagin D.V., Shilov G.V., Sanina N.A., Aldoshin S.M. Molecular and crystal structure of a cationic dinitrosyl iron complex with 1,3-dimethylthiourea	370
Slyvka Yu.I. Crystal structure of AgClO₄ p-complex with 2-amino-5-allylthio-1,3,4-thiadiazole of [Ag(C₅H₇N₃S₂)(ClO₄)] composition	373
Popov L.D., Borodkin S.А., Tkachev V.V., Tupolova Yu.P., Burlov A.S., Shilov G.V., Utenyshev A.N. Crystal structure of copper(ii) 2-methyl-3-{[3-methyl-5-oxo-1-phenylpyrazole-4-ylidene-methyl]amino}-quinazoline-4-onate	375
Mironova E.V., Krivolapov D.B., Litvinov I.A., Mustakimova L.V., Mamedov V.A. Molecular and crystal structure of 4-dichloromethylene-5-benzoyl-6-phenyl-perhydropyrimidin-2-one and its n(1)-substituted analogue	379
Popov L.D., Borodkin S.A., Tupolova Yu.P., Levchenkov S.I., Tkachev V.V., Burlov A.S., Tsaturyan A.A. Molecular and crystal structure of a novel Schiff base: 4-methyl-N-[2-[(2-methyl-4-oxo-quinazoline-3-yl)iminomethyl]phenyl]benzenesulfonamide	383
Jothi L., Anuradha G., Vasuki G., Ramesh Babu R., Ramamurthi K. Crystal structure of N-(p-methylbenzylidene)-p-bromoaniline	387
PROCEEDINGS of the 17^th Symposium on the intermolecular interaction and molecular conformations: to the 100^th anniversary of A.I. Kitaigorodsky, June 23—27, 2014, Pushchino, Russia
Grineva O.V. Analysis of aliphatic a,w-diols crystal structures. Application and progress of A.I. Kitaigorodsky’s ideas	390
Bogdan T.V., Alekseev E.S. Role of the conservative interhelical hydrogen bond SER74—TRP158 at the cholesterol binding site in the conformational stability of the b₂-adrenergic receptor: molecular dynamics simulation	402
Paston S.V., Nikolaev A.I., Ushkov P.A. Complexes of EDTA, thymidine and Cu²⁺ ions revealed by mass-spectrometry	410
Paston S.V., Polyanichko A.M., Shulenina O.V. Study of DNA interaction with Cu²⁺ and Mg²⁺ ions in the presence of caffeine	417
Kasyanenko N.A., Qiushi Z., Varshavskii M.S., Bakulev V.M., Demidov V.N. DNA metal complexes and metallization of a macromolecule in solution	424
Unksov I.N., Kasyanenko N.A. Conformational changes in the DNA molecule in solution caused by the binding of a light-sensitive cationic surfactant	431
Morozova E.A., Linkova N.S., Khavinson V.Kh., Soloviev A.Yu., Kasyanenko N.A. Interaction with peptide aedl DNA in vitro	438